属のアルファベット順による科名・目名一覧（作成途中・2025-11-19更新）
括弧内の和名は異名。和名のない学名の属名はカタカナ読みで表記。詳細は関連文献を参照。随時更新。
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2025.07.09 大村ほか(2025)を反映
2024.09.03 大村ほか(2023)を反映
2024.08.13 日本産地衣類および関連菌類(*)の属および和名について概ね網羅した（未解決部分あり）。学名属名をそのままカタカナ読みしているものは和名なし。括弧内は異名。
2024.07.04 環境省レッドリスト2020掲載種に関連する95属について、現行分類に沿って学名・和名を一覧表に示した。
| 属名 ( * 地衣生菌または関連菌を含む属を含む ) |
属の和名 （括弧内は異名） |
科名 | 科和名 | 文献 |
| Abrothallus * | クロコブチイヤドリ属 | Lichenoconiaceae | リケノコニウム科 | 3 4 |
| Acarospora * | ホウネンゴケ属 | Acarosporaceae | ホウネンゴケ科 | 4 |
| Acrocordia |
ホシゴケモドキ属 | Monoblastiaceae | トゲミゴケ科 | 4 |
| Acroscyphus | カニメゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 1 4 |
| Adelolecia | アカゾメチャクロイボゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Agonimia |
ツブゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Agyrium * | マダラゴケ属 | Agyriaceae | マダラゴケ科 | 4 |
| Ainoa | ミネヘリトリサラゴケ属 | Baeomycetaceae | ヒロハセンニンゴケ科 | 4 |
| Alectoria | ホネキノリ属（バンダイキノリ属） | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Alyxoria | ムツノキゴウゴケ属 | Lecanographaceae | シロイワボシゴケ科 | 4 |
| Amandinea | ヒメスミイボゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Amygdalaria |
クボミゴケモドキ属 |
Lecideaceae |
ゴイシゴケ科 |
4 |
| Anamylopsora | アナミロプソラ属 | Baeomycetaceae | ヒロハセンニンゴケ科 | 4 |
| Anaptychia | ヒメゲジゲジゴケ属 | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 4 |
| Anema | ジュズキノリ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Anisomeridium |
ニセゴマゴケ属 | Monoblastiaceae | トゲミゴケ科 | 4 |
| Anthracothecium |
ニキビゴケ属 | Pyrenulaceae | サネゴケ科 | 4 |
| Anzia | アンチゴケ属（ヒノデゴケ属） | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Arctomia | カワホリゴケモドキ属（タカネノリ属） | Arctomiaceae | カワホリゴケモドキ科（タカネノリ科） | 4 |
| Arctoparmelia | ワゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Arthonia * | ホシゴケ属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 1 4 |
| Arthopyrenia | ゴマゴケ属（ホシゴケモドキ属） | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Arthothelium | ゴマシオゴケ属（ソバカスゴケ属） | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Arthrorhaphis * |
レモンイボゴケ属 | Arthrorhaphidaceae | レモンイボゴケ科 | 4 |
| Asahinea | コガネトコブシゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Aspicilia | クボミゴケ属 | Megasporaceae | ニセクボミゴケ科 | 4 |
| Asterothyrium | フンカゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 4 |
| Astrothelium | アストロテリウム属 | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Athallia |
アタリア属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Aulaxina | ヨウジョウクロフチゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 4 |
| Bachmanniomyces * | バッハマンニオミセス属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Bacidia | イボゴケ属（タマボシ属） | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Bacidina | コナハリイボゴケ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Bactrospora | ニセイワボシゴケ属 | Incertae sedis (Arthoniales) | 所属不明（ホシゴケ目） | 4 |
| Baculifera | ニセスミイボゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Badimia | ヨツハシゴケ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 1 4 |
| Baeomyces | ヒロハセンニンゴケ属 | Baeomycetaceae | ヒロハセンニンゴケ科 | 1 4 |
| Bagliettoa | バグリエットア属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Bapalmuia | ナガミイボゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 1 4 |
| Barubria | ツエミハシゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 1 4 |
| Biatora | ツブミイボゴケ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Biatorella | タラコゴケ属 | Biatorellaceae | タラコゴケ科 | 4 |
| Biatoropsis * | ビアトロプシス属 | Incertae sedis (Tremellales) | 所属不明（シロキクラゲ目） | 4 |
| Bilimbia |
ウロコイボゴケ属 |
Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Blastenia |
ブラステニア属 |
Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Blennothallia |
ブレンノタリア属 |
Collemataceae | イワノリ科 | 4 |
| Bogoriella |
クロミダイゴケ属 |
Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Botryolepraria | ツブレプラゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Brigantiaea | サビイボゴケ属 | Brigantiaeaceae | サビイボゴケ科 | 1 4 |
| Brownliella | ブラウンリエラ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Bryobilimbia | ブリオビリンビア属 | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 4 |
| Bryocaulon | シダレキノリ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Bryoclavula | ブリオクラヴラ属 | Incertae sedis (Cantharellales) | アンズタケ目 | 4 |
| Bryonora | ムラサキツブミイボゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Bryoria | ハリガネキノリ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Buellia | スミイボゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Buelliella * | ブエリエラ属 | Incertae sedis (Dothideomycedtes) | 所属不明（クロイボタケ綱） | 4 |
| Bulbothrix | フトネゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Bunodophoron | ヒラサンゴゴケ属 | Sphaerophoraceae | サンゴゴケ科 | 4 |
| Byssolecania | ニセワタヘリゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Byssoloma | ワタヘリゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 1 4 |
| Calicium | ピンゴケ属（コナゴケ属） | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 1 4 |
| Calogaya | キクバダイダイゴケ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Calopadia |
チャハシゴケ属（ヨウジョウイボゴケ属） | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Caloplaca |
ダイダイゴケ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Calvitimela | ニセクロイボゴケ属 | Tephromelataceae | クロイボゴケ科 | 4 |
| Candelaria | ロウソクゴケ属 | Candelariaceae | ロウソクゴケ科 | 4 |
| Candelariella | ロウソクゴケモドキ属 | Candelariaceae | ロウソクゴケ科 | 4 |
| Canoparmelia | ハイイロウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Capronia * | カプロニア属 | Herpotrichiellaceae | ヘルポトリキエラ科 | 4 |
| Carbacanthographis | ウチグロモジゴケ属（シロクチモジゴケ属） | Graphidaceae | モジゴケ科 | 1 4 |
| Carbonea * | チャクロイボゴケモドキ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Carbonicola | カルボニコラ属 | Carbonicolaceae | カルボニコラ科 | 4 |
| Catapyrenium | アナウロコゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Catillaria * | フタゴイボゴケ属 | Catillariaceae | フタゴイボゴケ科 | 4 |
| Catolechia | キイロスミイボゴケ属 | Rhizocarpaceae | チズゴケ科 | 1 4 |
| Cecidonia * | ニキビチイ属 | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 4 |
| Ceramothyrium | ケラモチリウム属 | Chaetothyriaceae | ケートチリウム科 | 4 |
| Cercidospora * | セルシドスポラ属 | Incertae sedis (Dothideomycetes) | 所属不明（クロイボタケ綱） | 4 |
| Cetraria | エイランタイ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Cetrariella | トゲエイランタイ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Cetrariopsis | レモンゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Cetrelia | トコブシゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Cetreliopsis | アワビゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Chaenotheca | ホソピンゴケ属 | Coniocybaceae | ヌカゴケ科 | 4 |
| Chaenothecopsis * | ヒメピンゴケ属（ホソピンゴケモドキ属） | Mycocaliciaceae | アリピンゴケ科 | 4 |
| Chapsa | チャプサ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Chiodecton | ヒョウモンメダイゴケ属（イボダイゴケ属） | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 1 4 |
| Chrismofulvea | クリスモフルベア属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Chroodiscus | ボンゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 1 4 |
| Chrysothrix | コガネゴケ属（コヌカゴケ属） | Chrysotrichaceae | コガネゴケ科 | 4 |
| Circinaria | ツボイボゴケ属 | Megasporaceae | ニセクボミゴケ科 | 4 |
| Cladia | トゲシバリ属 | Cladoniaceae | ハナゴケ科 | 4 |
| Cladonia | ハナゴケ属 | Cladoniaceae | ハナゴケ科 | 1 4 |
| Cladophialophora * |
クラドフィアロフォラ属 | Herpotrichiellaceae | ヘルポトリキエラ科 | 4 |
| Clathroporina * | クラスロポリナ属 | Porinaceae | マルゴケ科 | 4 |
| Clauzadeana | クリイロニセクボミゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Clavascidium | キソウロコゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Cliostomum | イボゴケモドキ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Clypeococcum * | クリペオコックム属 | Polycoccaceae | ポリコックム科 | 4 |
| Clypeoria | スゲガサゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 4 |
| Coccocarpia | カワラゴケ属 | Coccocarpiaceae | カワラゴケ科 | 4 |
| Coccotrema | アナツブゴケ属 | Coccotremataceae | アナツブゴケ科 | 4 |
| Coenogonium | ダイダイサラゴケ属 | Coenogoniaceae | ダイダイサラゴケ科 | 4 |
| Collema | イワノリ属 | Collemataceae | イワノリ科 | 1 4 |
| Collemopsidium | シズミゴケ属 | Xanthopyreniaceae | キサントピレニア科 | 4 |
| Coniarthonia | コニアルソニア属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Coniocarpon | コニオカルポン属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Coniocybe | ヌカゴケ属 | Coniocybaceae | ヌカゴケ科 | 4 |
| Constrictolumina | ムニンゴマゴケ属 | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Cornicularia | ミヤマヒジキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 |
| Cornutispora * | コルヌティスポラ属 | Spirographaceae | ピラミッドチイヤドリ科 | 4 |
| Corticifraga * | コルティシフラガ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 4 |
| Corynespora * | コリネスポラ属 | Corynesporascaceae | コリネスポラ科 | 4 |
| Cresponea | カシゴケ属 | Opegraphaceae | キゴウゴケ科 | 4 |
| Crocynia | ワタゴケ属（カイメンゴケ属） | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Crypthonia | ニセゴフンゴケ属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Cryptodiscus * |
クリプトディスカス属 | Stictidaceae | スティクティス科 | 4 |
| Cyanopyrenia | シミズゴケ属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Cylindromopsis * | シリンドロモプシス属 | Nectriaceae | ベニアワツブタケ科 | 4 |
| Cyphellostereum |
イトアミゴケ属 | Hygrophoraceae | ヌメリガサ科 | 4 |
| Cyrtidula | シルティデュラ属 | Incertae sedis (Dothideomycetes) | 所属不明（クロイボタケ綱） | 4 |
| Dendriscosticta | アツバヨロイゴケ属 | Lobariaceae | カブトゴケ科 | 4 |
| Dendrographa | デンドログラファ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 4 |
| Dermatocarpon | カワイワタケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 1 4 |
| Dibaeis | センニンゴケ属 | Icmadophilaceae | アオシモゴケ科 | 4 |
| Dichosporidium | フェルトゴケ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 1 4 |
| Dictyocatenulata |
サントクチイ属 | Incertae sedis (Ostropomycetidae) | 所属不明（ピンタケ亜綱） | 4 |
| Dictyomeridium | ディクティオメリディウム属 | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Dictyonema | ケットゴケ属 | Hygrophoraceae | ヌメリガサ科 | 4 |
| Diorygma | シロコナモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Diploicia | オオバスミイボゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Diplolaeviopsis * |
ディプロラエヴィオプシス属 | Cordieritidaceae | クロハナビラタケ科 | 4 |
| Diploschistes | キッコウゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Diplotomma | クボミスミイボゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Dirinaria | メダルチイ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Distopyrenis * |
コザネゴケ属 | Pyrenulaceae | サネゴケ科 | 4 |
| Dyplolabia | オシロイクチビルモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Echinoplaca | ヒメヒゲチイ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 1 3 4 |
| Elixia | コヤスチイ属 | Elixiaceae | コヤスチイ科 | 4 |
| Enchylium | エンキリウム属 | Collemataceae | イワノリ科 | 1 4 |
| Endocarpon | ミドリゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Endococcus * | エンドコッカス属 | Incertae sedis (Dothideomycetes) | 所属不明（クロイボタケ綱） | 4 |
| Enterographa * | エンテログラファ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 1 4 |
| Eopyrenula | イシガキサネゴケ属 | Dacampiaceae | ダカンピア科 | 4 |
| Ephebe |
ケゴケ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Epicladonia | エピクラドニア属 | Incertae sedis (Leotiomycetidae) | 所属不明（ズキンタケ亜綱） | 4 |
| Epigloea * | エピグロエア属 | Epigloeaceae | エピグロエア科 | 4 |
| Epilichen | キョウゾンスミイボゴケ属 | Rhizocarpaceae | チズゴケ科 | 4 |
| Epithamnolia * |
エピタムノリア属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Eremothecella | ミミズホシゴケ属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Erioderma | ヌマジリゴケ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 1 |
| Eugeniella | アマミイボゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 1 4 |
| Evernia | ヤマヒコノリ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Farnoldia | スルスミヘリトリゴケ属 | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 4 |
| Fauriea | ファウリエア属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Fellhanera | コバシラゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 1 4 |
| Fellhaneropsis | ニセコバシラゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Fissurina | スジモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 1 4 |
| Flakea | ハギレゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Flavocetraria | コガネエイランタイ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Flavoparmelia | キウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Flavoplaca | フラボプラカ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Flavopunctelia | ヒメキウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Fouragea | アオバキゴウゴケ属 | Opegraphaceae | キゴウゴケ科 | 3 4 |
| Fuscidea | ヘリトリイボゴケ属（チャヘリトリゴケ属） | Fuscideaceae | ヘリトリイボゴケ科（チャヘリトリゴケ科） | 1 4 |
| Fuscopannaria | ヒメハナビラゴケ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Galbinothrix |
ガルビノスリックス属 | Chrysotrichaceae | コガネゴケ科 | 4 |
| Gallaicolichen | ノミノサカズキチイ属 | Porinaceae | マルゴケ科 | 3 4 |
| Gassicurtia | コウヤイボゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Gibbosporina | ムニンゴケ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 1 4 |
| Glyphis | アミモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Graphidastra | アシカゴケ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 4 |
| Graphis | モジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Gyalecta | サラゴケ属 | Gyalectaceae | サラゴケ科 | 4 |
| Gyalectidium | クボミサラゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 1 4 |
| Gyalidea | コザラゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 4 |
| Gyalideopsis | ニセコザラゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 4 |
| Gyalolechia | ツブダイダイゴケ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Gymnoderma | ツブミゴケ属 | Cladoniaceae | ハナゴケ科 | 1 4 |
| Gyrographa | ヒカゲキゴウゴケ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 4 |
| Haematomma | ザクロゴケ属 | Haematommataceae | ザクロゴケ科 | 4 |
| Hainesia * | ハイネシア属 | Chaetomellaceae | ケートメラ科 | 4 |
| Halegrapha | モジゴケモドキ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Hemithecium | スジシロモジゴケ属（ミゾモジゴケ属） | Graphidaceae | モジゴケ科 | 1 4 |
| Herpothallon | ゴフンゴケ属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Heterodermia | ゲジゲジゴケ属 | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 1 4 |
| Homostegia * | ホモステギア属 | Incertae sedis (Dothideomycetes) | 所属不明（クロイボタケ綱） | 4 |
| Huriopsis | コガネビスケットゴケ属 | Physciaceae | ムカデゴケ科 | |
| Hyalopyrenia | シロザネゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Hydropunctaria | ゴマダラゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Hyperphyscia | コカゲチイ属（ヒラムシゴケ属） | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 1 4 |
| Hypocenomyce |
コナウロコゴケ属 | Ophioparmaceae | イワザクロゴケ科 | 4 |
| Hypogymnia | フクロゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Hypotrachyna | ゴンゲンゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Icmadophila | アオシモゴケ属（シモゴケ属） | Icmadophilaceae | アオシモゴケ科 | 1 4 |
| Illosporium * | イロスポリウム属 | Incertae sedis (Hypocreales) | 所属不明（ボタンタケ目） | 4 |
| Immersaria | クリイロクボミゴケモドキ属 | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 4 |
| Imsahugia | ゴヘイゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Ingvariella | キッコウゴケモドキ属 | Stictidaceae | スティクティス科 | 4 |
| Inoderma | コナユキゴケ属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Intralichen * | イントラリケン属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Ionaspis | イワアバタゴケ属 | Hymeneliaceae | ヒメネリア科 | 4 |
| Japewia | クリイボゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Julella | コアミゴケ属 | Thelenellaceae | オオアミゴケ科 | 4 |
| Kashiwadia | シロムカデゴケ属 | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 4 |
| Kroswia | イワノリモドキ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Kuettlingeria | クエットリンゲリア属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Lasioloma | ワタハシゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Lasiosphaeriopsis * | ラシオスファエリオプシス属 | Nitschkiaceae | ニチキア科 | 4 |
| Lathagrium | ラタグリウム属 | Collemataceae | イワノリ科 | 1 4 |
| Lecania | シブゴケ属（ササクレゴケ属） | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Lecanographa | シロイワボシゴケ属 | Lecanographaceae | シロイワボシゴケ科 | 4 |
| Lecanora | チャシブゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Lecidea | ゴイシゴケ属（サキノヘリトリゴケ属、ヘリトリゴケ属【広義】） | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 1 4 |
| Lecidella | チャクロイボゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Lecidoma | ツンドラカイガラゴケ属 | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 4 |
| Leioderma | ニセハナビラゴケ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 1 4 |
| Leiorreuma | ヘリトリモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 1 4 |
| Lepidocollema | マットゴケ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 1 4 |
| Lepra | カノコゴケ属 | Pertusariaceae | トリハダゴケ科 | 4 |
| Lepraria | レプラゴケ属 | Stereocaulaceae | キゴケ科 | 4 |
| Leprocaulon | レプロカウロン属 | Leprocaulaceae | レプロカウロン科 | 4 |
| Leptogidium | ケクズゴケ属（ミヤマケゴケ属） | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Leptogium | アオキノリ属 | Collemataceae | イワノリ科 | 4 |
| Leptorhaphis | ホソミゴマゴケ属 | Naetrocymbaceae | ネトロキンベ科 | 4 |
| Leptosphaeria * |
レプトスファエリア属 | Leptosphaeriaceae | レプトスファエリア科 | 4 |
| Lethariella | ナヨナヨサガリゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Letrouitia | キンカンゴケ属 | Letrouitiaceae | キンカンゴケ科 | 1 4 |
| Leucodecton | カイラギアバタゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Lichenochora * | リケノコラ属 | Phyllachoraceae | クロカワキン科 | 4 |
| Lichenoconium * | リケノコニウム属 | Lichenoconiaceae | リケノコニウム科 | 4 |
| Lichenodiplis * | リケノディプリス属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Lichenomphalia | アオウロコタケ属 | Hygrophoraceae | ヌメリガサ科 | 4 |
| Lichenopeltella * | リケノペルテラ属 | Microthyriaceae | ミクロチリウム科 | 4 |
| Lichenopuccinia * | サビビョウモドキ属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 3 4 |
| Lichenosticta * |
リケノスティクタ属 | Incertae sedis (Lecanorales) | 所属不明（チャシブゴケ目） | 4 |
| Lichenostigma * | リケノスティグマ属 | Phaeococcomycetaceae | フエオコッコマイセス科 | 4 |
| Lichenothelia * |
リケノテリア属 | Lichenotheliaceae | リケノテリア科 | 4 |
| Lichinella |
レンダイゴケ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Lithographa | イワキゴウウゴケモドキ属 | Xylographaceae | モクハンゴケ科 | 3 4 |
| Lithothelium |
ヒメサネゴケ属 | Pyrenulaceae | サネゴケ科 | 4 |
| Lobaria | カブトゴケ属 | Lobariaceae | カブトゴケ科 | 1 4 |
| Lobarina | ハイイロカブトゴケ属 | Lobariaceae | カブトゴケ科 | 4 |
| Lobothallia | ウロコクボミゴケ属 | Megasporaceae | ニセクボミゴケ科 | 1 4 |
| Loflammia | ベニハシゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 1 4 |
| Lopadium | ツブウスゴケ属（アワダチゴケ属） | Lopadiaceae | ツブウスゴケ科 | 4 |
| Loxospora | チャザクロゴケ属 | Sarrameanaceae | サルラメアナ科 | 1 4 |
| Malmidea | ツブイボゴケ属 | Malmideaceae | ツブイボゴケ科 | 1 4 |
| Marchandiomyces * | マルカンディオミセス属 | Corticiaceae | コウヤクタケ科 | 4 |
| Maronea | アオチャゴケ属 | Fuscideaceae | ヘリトリイボゴケ科 | 1 4 |
| Massalongia | マッサロンゴゴケ属 | Massalongiaceae | ッサロンゴゴケ科 | 4 |
| Mazosia | フシアナゴケ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 4 |
| Megalotremis | オオゴマゴケ属 | Monoblastiaceae | トゲミゴケ科 | |
| Megalospora | コゲボシゴケ属（クロコボシ属，クロコボシゴケ属） | Megalosporaceae | コゲボシゴケ科 | 4 |
| Megaspora | ニセクボミゴケ属 | Megasporaceae | ニセクボミゴケ科 | 4 |
| Melanelia | タカネゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Melanelixia | オリーブゴケモドキ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Melanohalea | オリーブゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Melarthonis | メラルトニス属 | Chrysotrichaceae | コガネゴケ科 | 4 |
| Melaspilea | フタゴゴケ属 | Melaspileaceae | フタゴゴケ科 | 4 |
| Menegazzia | センシゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Merismatium * |
メリスマティウム属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Micarea * | タマイボゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Microcalicium * |
ミクロカリシウム属 | Microcaliciaceae | ミクロカリシウム科 | 4 |
| Microtheliopsis | シズクゴケ属 | Microtheliopsidaceae | シズクゴケ科 | 1 4 |
| Microxyphiomyces | ヨウジョウヒゲゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 1 4 |
| Milospium * | ミロスピウム属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Minutoexcipula * |
ミニュトエクシプラ属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Miriquidica | クリイロクボミゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Monoblastia | トゲミゴケ属 | Monoblastiaceae | トゲミゴケ科 | 4 |
| Montanelia | ヒモタカネゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Muellerella * | ミューラーエラ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Multiclavula |
シラウオタケ属（キリタケ属） | Hydnaceae | カノシタ科（ハリタケ科） | 4 |
| Mycoblastus | クロアカゴケ属 | Tephromelataceae | クロイボゴケ科 | 4 |
| Mycocalicium * | アリピンゴケ属（チビピンゴケ属） | Mycocaliciaceae | アリピンゴケ科 | 4 |
| Mycomicrothelia | クロミダイゴケ属 | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Myelochroa | ウチキウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Myriospora | ミリオスポラ属 | Acarosporaceae | ホウネンゴケ科 | 4 |
| Myriotrema | ハリアナゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Neobrownliella | ネオブラウンリエラ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Neocatapyrenium | ミョウギウロコゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Nephroma | ウラミゴケ属 | Nephromataceae | ウラミゴケ科 | 4 |
| Nephromopsis | オオアワビゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Nipponoparmelia | テリハゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Nitidochapsa | ニチドチャプサ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Normandina | ノルマンゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Nyungwea | クチナワゴケ属 | Opegraphaceae | キゴウゴケ科 | 4 |
| Ocellularia | カコウゴケ属（メゴケ属） | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Ochrolechia |
ニクイボゴケ属 | Ochrolechiaceae | ニクイボゴケ科 | 4 |
| Opegrapha * | キゴウゴケ属 | Opegraphaceae | キゴウゴケ科 | 4 |
| Opeltia | オペルティア属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Ophioparma | イワザクロゴケ属 | Ophioparmaceae | イワザクロゴケ科 | 1 4 |
| Orientophila | オリエントフィラ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Oropogon | ミヤマクグラ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Orphniospora | チャイロヘリトリゴケ属 | Fuscideaceae | ヘリトリイボゴケ科 | 1 4 |
| Ovicuculispora * | カッコウチイヤドリ属 | Bionectriaceae | ビオネクトリア科 | 3 4 |
| Oxneriopsis | オキシネリオプシス属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Pachyphiale | コウスゴケ属 | Gyalectaceae | サラゴケ科 | 4 |
| Pallidogramme | セスジシロモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Pannaria | ハナビラゴケ属（ヒメヨロイゴケ属） | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Parainoa | パラアイノア属 | Baeomycetaceae | ヒロハセンニンゴケ科 | 4 |
| Paranectria * | パラネクトリア属 | Bionectriaceae | ビオネクトリア科 | 4 |
| Paraporpidia | ヒメヘリトリゴケ属 | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 4 |
| Parmelia | カラクサゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Parmeliella | シコロゴケ属（コバノカラクサゴケ属） | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Parmelina | ナリアイウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Parmelinella | ワリキウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Parmeliopsis | ゴヘイゴケモドキ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Parmotrema | ウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Paulia | ヤブレガサゴケ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 1 4 |
| Peltigera | ツメゴケ属 | Peltigeraceae | ツメゴケ科 | 1 4 |
| Peltula |
ゲパンゴケ属（”タテゴケ属”はPsoraへの後続同名） | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Perigrapha * |
ペリグラファ属 | Incertae sedis (Arthoniales) | 所属不明（ホシゴケ目） | 4 |
| Pertusaria | トリハダゴケ属 | Pertusariaceae | トリハダゴケ科 | 1 4 |
| Petractis |
ヒメサラゴケ属 | Incertae sedis (Ostropales) | 所属不明（ピンタケ目） | 4 |
| Phacopsis * | ヤドリホウネンゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Phaeocalicium * | ノミピンゴケ属 | Mycocaliciaceae | アリピンゴケ科 | 4 |
| Phaeographis | クロミモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 1 4 |
| Phaeophyscia | クロムカデゴケ属（クロウラムカデゴケ属） | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 4 |
| Phaeospora * | ファエオスポラ属 | Incertae sedis (Dothideomycetes) | 所属不明（クロイボタケ綱） | 4 |
| Phloeopeccania | フロエオペッカニア属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Phylliscum |
ヤスデゴケモドキ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Phyllogyalidea | ヨウジョウコザラゴケ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 4 |
| Phyllopsora | ウロコイボゴケ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Physcia | ムカデゴケ属 | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 4 |
| Physciella | ロゼットチイ属（ムカデコゴケ属） | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 4 |
| Physconia | ハクフンゴケ属 | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 1 4 |
| Physma | アツバキノリ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Pilophorus | カムリゴケ属 | Cladoniaceae | ハナゴケ科 | 4 |
| Placidium | ヒメカワイワタケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Placocarpus | プラコカルプス属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Placopsis | デイジーゴケ属 | Trapeliaceae | バラゴケ科 | 4 |
| Placynthiella | クロサビコゴケ属 | Trapeliaceae | バラゴケ科 | 4 |
| Placynthium | クロサビゴケ属 | Placynthiaceae | クロサビゴケ科 | 4 |
| Platismatia | ウスバトコブシゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Platygramme | ヒロフチモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 1 4 |
| Platythecium | チビミモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Polychidium | ポリキディウム属 | Massalongiaceae | マッサロンゴゴケ科 | 4 |
| Polycoccum * | ポリコックム属 | Polycoccaceae | ポリコックム科 | 4 |
| Polymeridium | ポリメリディウム属 | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Polyozosia | ポリオゾシア属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Porina | マルゴケ属（ホルトノキゴケ属） | Porinaceae | マルゴケ科 | 1 4 |
| Porpidia | ヘリトリゴケ属 | Lecideaceae | ゴイシゴケ科 | 4 |
| Pronectria * | ヤドリアカツブタケ属 | Bionectriaceae | ビオネクトリア科 | 3 4 |
| Protoblastenia | ニセザクロゴケ属 | Psoraceae | タテゴケ科 | 4 |
| Protomicarea | プロトミカレア属 | Psoraceae | タテゴケ科 | 4 |
| Protopannaria | チャワンタケモドキ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Protoparmelia | ムカシウメノキゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Protoparmeliopsis | キクバチャシブゴケ属 | Lecanoraceae | チャシブゴケ科 | 4 |
| Protothelenella * | クロコイボゴケ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 3 4 |
| Protounguicularia * | プロトウングイクラリア属 | Hyaloscyphaceae | ヒナノチャワンタケ科 | 4 |
| Pseudephebe | タカネケゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Pseudobaeomyces |
オオセンニンゴケ属 | Icmadophilaceae | アオシモゴケ科 | 4 |
| Pseudocalopadia | チャサジゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Pseudochapsa | シュードチャプサ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Pseudocyphellaria | キンブチゴケ属 | Lobariaceae | カブトゴケ科 | 1 4 |
| Pseudopyrenula | モツレサネゴケ属 | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Psilolechia | コナゴケ属 | Psilolechiaceae | コナゴケ科 | 4 |
| Psora | タテゴケ属（カイガラゴケ属） | Psoraceae | タテゴケ科 | 1 2 4 |
| Psoroglaena | ムキミゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Psoroma | ムニンゴケ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Psorula | ヒメカイガラゴケ属 | Psoraceae | タテゴケ科 | 4 |
| Pterygiopsis |
モツレノリ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Pulvinodecton | コナダイゴケ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 4 |
| Punctelia | ハクテンゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Pyrenidium * | ピレニディウム属 | Pyrenidiaceae | ピレニディウム科 | 4 |
| Pyrenopsis | モツレノリ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | |
| Pyrenula |
サネゴケ属 | Pyrenulaceae | サネゴケ科 | 4 |
| Pyrgillus | エントツゴケ属 | Pyrenulaceae | サネゴケ科 | 1 4 |
| Pyxine | クロボシゴケ属（クロボシ属） | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 1 4 |
| Racodium | イワゴケモドキ属 | Racodiaceae | イワゴケモドキ科 | 4 |
| Racoleus | イワゴケ属 | Teratosphaeriaceae | テラトスファエリウム科 | 4 |
| Raesaenenia * |
ラエサエネニア属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Ramalina | カラタチゴケ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 1 4 |
| Ramalodium | ヒメキノリ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 1 4 |
| Ramboldia | ニセザクロゴケ属 | Ramboldiaceae | ニセザクロゴケ科 | 4 |
| Ramonia | ホシクチゴケ属 | Gyalectaceae | サラゴケ科 | 4 |
| Reconditella * | ヘリツキチイヤドリ属 | Incertae sedis (Sordariales) | 所属不明（フンタマカビ目） | 3 4 |
| Relicina | キフトネゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Remototrachyna | ゴンゲンゴケモドキ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Rhabdodiscus | アナゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Rhabdospora * |
ラブドスポラ属 | Mycosphaerellaceae | ミコスファエレラ科 | 4 |
| Rhaphidicyrtis | ラフィディキルティス属 | Incertae sedis (Prenulales) | 所属不明（サネゴケ目） | 4 |
| Rhizocarpon | チズゴケ属 | Rhizocarpaceae | チズゴケ科 | 4 |
| Ricasolia | エビラゴケ属 | Lobariaceae | カブトゴケ科 | 4 |
| Rimularia | ニセニキビチイ属 | Trapeliaceae | バラゴケ科 | 4 |
| Rinodina | ビスケットゴケ属 | Physciaceae | ムカデゴケ科 | 4 |
| Roccellina | ヘリブトゴケ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 4 |
| Ropalospora | チャイボゴケ属 | Schaereriaceae | シャエレリア科 | 4 |
| Roselliniella * | クロツボチイヤドリ属 | Incertae sedis (Sordariales) | 所属不明（フンタマカビ目） | 4 |
| Roselliniopsis * |
ロゼリニオプシス属 | Incertae sedis (Sordariales) | 所属不明（フンタマカビ目） | 4 |
| Rostania | ロスタニア属 | Collemataceae | イワノリ科 | 1 4 |
| Rufoplaca | ルフォプラカ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Rusavskia | オオロウソクゴケモドキ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Sagedia | サゲディア属 | Megasporaceae | ニセクボミゴケ科 | 4 |
| Sagediopsis * | サゲディオプシス属 | Adelococcaceae | アデロコッカス科 | 4 |
| Sagiolechia | ツムゴケ属 | Sagiolechiaceae | ツムゴケ科 | 4 |
| Santessoniella | モクズゴケ属 | Pannariaceae | ハナビラゴケ科（ヒメヨロイゴケ科） | 4 |
| Sarcographa | ホシダイゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Sarcogyne * | カクレホウネンゴケ属 | Acarosporaceae | ホウネンゴケ科 | 4 |
| Schismatomma | メダイゴケ属 | Roccellaceae | リトマスゴケ科 | 4 |
| Sclerococcum * | ヤドリクロビョウタケ属 | Sclerococcaceae | ヤドリクロビョウタケ科 | 3 4 |
| Sclerophora | サビクギゴケ属 | Coniocybaceae | ヌカゴケ科 | 1 4 |
| Sclerophyton | タツゴケ属 | Opegraphaceae | キゴウゴケ科 | 4 |
| Scleropyrenium | クロミゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Scoliciosporum | マキミゴケ属 | Scoliciosporaceae | マキミゴケ科 | 4 |
| Sculptolumina | ヤマトスミイボゴケ属 | Caliciaceae | ピンゴケ科 | 4 |
| Scutula * | スクトゥラ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Scytinium | ヒメアオキノリ属 | Collemataceae | イワノリ科 | 1 4 |
| Seawardiella | シーワーディエラ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Semigyalecta | ニセサラゴケ属 | Incertae sedis (Lecanoromycetes) | 所属不明（チャシブゴケ綱） | 1 4 |
| Siphula | シロツノゴケ属 | Icmadophilaceae | アオシモゴケ科 | 1 4 |
| Skyttea * | スキッテア属 | Cordieritidaceae | クロハナビラタケ科 | 4 |
| Skyttella * | スキッテラ属 | Cordieritidaceae | クロハナビラタケ科 | 4 |
| Solenopsora | アサヒナゴケ属 | Catillariaceae | フタゴイボゴケ科 | 4 |
| Solorina | ヤイトゴケ属 | Peltigeraceae | ツメゴケ科 | 1 4 |
| Sphaerellothecium * | アミダマチイヤドリ属 | Mycosphaerellaceae | ミコスファエレラ科 | 3 4 |
| Sphaeropezia * |
スファエロペジア属 | Odontotremataceae | オドントトレマ科 | 4 |
| Sphaerophorus | サンゴゴケ属 | Sphaerophoraceae | サンゴゴケ科 | 4 |
| Sphinctrina * | イチジクゴケ属 | Sphinctrinaceae | イチジクゴケ科 | 4 |
| Spilonema | カタマリケゴケ属 | Coccocarpiaceae | カワラゴケ属 | 4 |
| Spinomyces | ヨウジョウシロヒゲ属 | Gomphillaceae | ヒゲチイ科 | 1 4 |
| Spirographa * |
ピラミッドチイヤドリ属 | Spirographaceae | ピラミッドチイヤドリ科 | 4 |
| Sporastatia | ホウネンゴケモドキ属 | Sporastatiaceae | ホウネンゴケモドキ科 | 4 |
| Sporodophoron | コナユキゴケ属 | Arthoniaceae | ホシゴケ科 | 4 |
| Sporopodium | アミハシゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Squamulea | ウロコダイダイゴケ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Staurolemma | ニセヒメキノリ属（クロカワノリ属） | Pannariaceae | ハナビラゴケ科 | 4 |
| Staurothele | ミドリサネゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Stenocybe * |
クギゴケ属 | Mycocaliciaceae | アリピンゴケ科 | 4 |
| Stereocaulon | キゴケ属 | Stereocaulaceae | キゴケ科 | 1 4 |
| Sticta | ヨロイゴケ属 | Lobariaceae | カブトゴケ科 | 1 4 |
| Stigmidium * | ヤドリマルミゴケモドキ属（マルミゴケモドキ属） | Mycosphaerellaceae | ミコスファエレラ科 | 4 |
| Strangospora | マンサクゴケ属 | Strangosporaceae | マンサクゴケ科 | 4 |
| Strigula | アオバゴケ属（マンジュウゴケ属） | Strigulaceae | アオバゴケ科（マンジュウゴケ科） | 1 4 |
| Sulcaria | バンダイキノリ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Sulcopyrenula |
ワレミサネゴケ属 | Pyrenulaceae | サネゴケ科 | 4 |
| Sulzbacheromyces | スルツバッハロミセス属 | Lepidostromataceae | レピドストロマ科 | 4 |
| Synalissa |
アカツブノリ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 4 |
| Taeniolella * | タエニオレラ属 | Mytilinidiaceae | ミティリニディオン科 | 4 |
| Talpapellis * | タルパペリス属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 4 |
| Tapellaria | クロハシゴケ属 | Pilocarpaceae | ヤシノアオバゴケ科 | 4 |
| Tephromela | クロイボゴケ属 | Tephromelataceae | クロイボゴケ科 | 4 |
| Thalloidima | タロイディマ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 4 |
| Thamnogalla * | タムノガラ属 | Cordieritidaceae | クロハナビラタケ科 | 4 |
| Thamnolia |
ムシゴケ属 | Icmadophilaceae | アオシモゴケ科 | 4 |
| Thecaria | モリアガリモジゴケ属 | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Thelenella |
オオアミゴケ属 | Thelenellaceae | オオアミゴケ科 | 4 |
| Thelidium | マルミゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Thelocarpon | キツブゴケ属 | Thelocarpaceae | キツブゴケ科 | 4 |
| Thelotrema | チブサゴケ属（フジゴケ属） | Graphidaceae | モジゴケ科 | 4 |
| Thyrea | キセガワノリ属 | Lichinaceae | ツブノリ科（ヒメイワゴケ科） | 1 4 |
| Thysanothecium | フクレヘラゴケ属 | Cladoniaceae | ハナゴケ科 | 4 |
| Tingiopsidium | オンタケキノリ属 | Koerberiaceae | ケルベリア科 | 4 |
| Tomasellia * | トマセリア属 | Naetrocymbaceae | ネトロキンベ科 | 4 |
| Toninia | フジカワゴケ属 | Ramalinaceae | カラタチゴケ科 | 1 4 |
| Trapelia | バラゴケ属（ヘリトリサラゴケ属） | Trapeliaceae | バラゴケ科 | 4 |
| Trapeliopsis | バラゴケモドキ属（ヘリトリサラゴケモドキ属） | Trapeliaceae | バラゴケ科 | 4 |
| Tremella * | シロキクラゲ属 | Tremellaceae | シロキクラゲ科 | 4 |
| Tremolecia | タカネクロヘリトリゴケ属 | Hymeneliaceae | ヒメネリア科 | 4 |
| Trichothelium |
ホシサネゴケ属 | Porinaceae | マルゴケ科 | 4 |
| Trinathotrema |
トリナトトレマ属 | Stictidaceae | スティクティス科 | 4 |
| Trizodia | トリゾディア属 | Incertae sedis (Leotiomycetidae) |
所属不明（ズキンタケ亜綱） | |
| Trypetheliopsis | アカチクビゴケ属（ウメボシゴケ属） | Monoblastiaceae | トゲミゴケ科 | 1 4 |
| Trypethelium | チクビゴケ属（マメゴケ属） | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Tuckermannopsis | ヒゲアワビゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Tuckneraria | ウスカワゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Umbilicaria | イワタケ属 | Umbilicariaceae | イワタケ科 | 1 4 |
| Usnea | サルオガセ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Usnocetraria | オーアケシゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 1 4 |
| Vahliella | コバノモクズゴケ属 | Vahliellaceae | コバノモクズゴケ科 | 4 |
| Varicellaria |
フタゴトリハダゴケ属 | Varicellariaceae | フタゴトリハダゴケ科 | 4 |
| Verrucaria | アナイボゴケ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Viridothelium |
ヴィリドテリウム属 | Trypetheliaceae | チクビゴケ科（マメゴケ科） | 4 |
| Vouauxiella * | ミドリクサリチイヤドリ属 | Incertae sedis (Pezizomycotina) | 所属不明（チャワンタケ亜門） | 3 4 |
| Vulpicida | ハイマツゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Wahlenbergiella | ヴァーレンベルギエラ属 | Verrucariaceae | アナイボゴケ科 | 4 |
| Xanthomendoza | オオロウソクゴケ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Xanthoparmelia | キクバゴケ属 | Parmeliaceae | ウメノキゴケ科 | 4 |
| Xylographa | モクハンゴケ属 | Xylographaceae | モクハンゴケ科 | 4 |
| Xylopsora | キシロプソラ属 | Umbilicariaceae | イワタケ科 | 4 |
| Yoshimuria | ヨシムリア属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Zeroviella | アカサビゴケ属 | Teloschistaceae | ダイダイキノリ科 | 4 |
| Zwackhia | ツヴァッキア属 | Lecanographaceae | シロイワボシゴケ科 | 4 |
| Zwackhiomyces * | ツヴァッキオミケス属 | Xanthopyreniaceae | キサントピレニア科 | 4 |
関連文献：
1). 大村嘉人・柏谷博之・竹下俊治・宮脇博巳・吉田考造・宮澤研人（2024）日本産地衣類の高次分類群について（１）環境省レッドリスト2020関連．ライケン23(1): 9-18.
2). 井上正鉄・柏谷博之・宮脇博巳・中西稔・大村嘉人（2010）日本産地衣類の属とその和名一覧．ライケン16: 9-13.
3). 大村嘉人・田留健介・宮澤研人．2023．地衣類および地衣生菌の新和名Ⅰ．ライケン22: 25–30.
4). 大村嘉人・宮澤研人・田留健介・竹下俊治・宮脇博巳・吉田考造・柏谷博之．2025．日本産地衣類の高次分類群について（２）地衣類および関連菌類の分類体系．ライケン23: 37-48.
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